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共有 1189 人关注过本帖
标题:求修改一下程序,程序没问题。
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a13780393
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求修改一下程序,程序没问题。
sequence.zip (11.65 KB)
#include
 #include
 #include
 
void dna8_val2str( unsigned long val, char str[8] )
 {
     assert( val < (1ul<<(8*2)) );
 
    for( size_t i=0; i<8; ++i )
     {
         str[7-i] = "agct"[val%4];
         val >>= 2;
     }
 }
 
int main()
 {
     unsigned long words = 0;
     unsigned long numbers[65536] = { 0 };
 
    // 处理
     FILE* fin = fopen( "sequence.txt", "r" );
     if( !fin )
         return 1;
     int bav = 0;
     unsigned long val = 0;
     for( int c; c=fgetc(fin), c!=EOF; )
     {
         switch( c )
         {
         case '@': // 遇到@则结束
             break;
         case '\r':
         //case '\n':
             ++words;
             continue;
         case 'a':
         case 'g':
         case 'c':
         case 't':
             val = ((val<<2)&0xFFFF) | (c%36%5);
             if(bav<8) // 不足8个有效字符时先等等
                 ++bav;
             else
                 ++numbers[val];
             break;
         default: // 出现了agct之外的字符
             long pos = ftell(fin)-1;
             if( c>0x20 && c<0xFF ) // 可显示的字符,就显示其本身
                 printf( "--- 0x%08lX处出现非法字符\'%c\'\n", pos, (char)c );
             else // 不可显示的字符,就显示其对应的ASCII值
                 printf( "--- 0x%08lX处出现非法字符0x%02hhX\n", pos, (char)c );
         }
     }
     fclose( fin );
 
    // 输出
     FILE* fout = fopen( "result.txt", "w" );
     if( !fout )
         return 3;
     for( int i=0; i<65536; ++i )
     {
         // if( numbers[i] !=0 )
         {
             char str[8];
             dna8_val2str( i, str );
             fprintf( fout, "%.8s\t%ld\t%f\n", str, numbers[i], numbers[i]/65536.0 );
         }
     }
     fclose( fout );
     printf( "处理完毕\n" );
 
    return 0;
 }
程序没有问题,现在这个是统计8个字符的问题。我想改成统计四个字符的程序,自己改了半天也没成功。你可以先运行一下附件,看结果,然后就明白我说的意思了。
搜索更多相关主题的帖子: return numbers include long 
2013-01-14 11:10
wp231957
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你看不懂原来的程序   自然就无法更改

此贴也可定义为求代码贴

DO IT YOURSELF !
2013-01-14 11:14
a13780393
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回复 2楼 wp231957
那你帮我看一下吧,大兄弟!万分感谢!!!
2013-01-14 19:20
神龙赖了
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程序代码:
#include
#include
#include 

头文件倒是可以修改修改...

I have not failed completely
2013-01-14 19:31
浅水无殇
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回复 2楼 wp231957
犀利,残忍。。。

wula wual
2013-01-14 19:35
a13780393
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回复 4楼 神龙赖了
大兄弟,你帮我修改一下吧,我是学生物的很少用到编程,现在研三了,马上要毕业,却需要统计基因频数,我自己不太会编程,现学时间不够了,明年3月份论文都得写出来,现在却遇到了这个问题,出不来结果。万分感谢!!!
2013-01-14 19:37
a13780393
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回复 4楼 神龙赖了
标头,我写的漏了,是这个。
#include <stdio.h>
#include <string.h>
 #include <assert.h>
 
void dna8_val2str( unsigned long val, char str[8] )
 {
     assert( val < (1ul<<(8*2)) );
 
    for( size_t i=0; i<8; ++i )
     {
         str[7-i] = "agct"[val%4];
         val >>= 2;
     }
 }
 
int main()
 {
     unsigned long words = 0;
     unsigned long numbers[65536] = { 0 };
 
    // 处理
     FILE* fin = fopen( "sequence.txt", "r" );
     if( !fin )
         return 1;
     int bav = 0;
     unsigned long val = 0;
     for( int c; c=fgetc(fin), c!=EOF; )
     {
         switch( c )
         {
         case '@': // 遇到@则结束
             break;
         case '\r':
         //case '\n':
             ++words;
             continue;
         case 'a':
         case 'g':
         case 'c':
         case 't':
             val = ((val<<2)&0xFFFF) | (c%36%5);
             if(bav<8) // 不足8个有效字符时先等等
                 ++bav;
             else
                 ++numbers[val];
             break;
         default: // 出现了agct之外的字符
             long pos = ftell(fin)-1;
             if( c>0x20 && c<0xFF ) // 可显示的字符,就显示其本身
                 printf( "--- 0x%08lX处出现非法字符\'%c\'\n", pos, (char)c );
             else // 不可显示的字符,就显示其对应的ASCII值
                 printf( "--- 0x%08lX处出现非法字符0x%02hhX\n", pos, (char)c );
         }
     }
     fclose( fin );
 
    // 输出
     FILE* fout = fopen( "result.txt", "w" );
     if( !fout )
         return 3;
     for( int i=0; i<65536; ++i )
     {
         // if( numbers[i] !=0 )
         {
             char str[8];
             dna8_val2str( i, str );
             fprintf( fout, "%.8s\t%ld\t%f\n", str, numbers[i], numbers[i]/65536.0 );
         }
     }
     fclose( fout );
     printf( "处理完毕\n" );
 
    return 0;
 }
2013-01-14 19:39
神龙赖了
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以下是引用a13780393在2013-1-14 19:37:15的发言:

大兄弟,你帮我修改一下吧,我是学生物的很少用到编程,现在研三了,马上要毕业,却需要统计基因频数,我自己不太会编程,现学时间不够了,明年3月份论文都得写出来,现在却遇到了这个问题,出不来结果。万分感谢!!!
我擦,这么严重啊,亚历山大啊...
好吧,那我就冒着被老师罚站的风险来改一改吧...
其实我本来就不想做作业...

I have not failed completely
2013-01-14 19:45
a13780393
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回复 8楼 神龙赖了
这个程序来统计8个字符完全能用,运行一下我上传的附件就能看到结果,现在我要统计4个字符。统计8 个字符时,4的8次方=65536,是这么来的。当统计4个字符时,是4的4次方=256。同理4的6次方=4096。现在只要统计4个字符就行了。
2013-01-14 19:49
神龙赖了
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图片附件: 游客没有浏览图片的权限,请 登录注册

这程序在我这儿有错误啊,你用的是哪个编辑器啊?

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2013-01-14 19:56
快速回复:求修改一下程序,程序没问题。
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