一个做好的计算工程， 另一个做好的画图工程，怎么能够组合成一个大的工程？

可以的，先打开主工程，再添加窗体，模块，等。选择现存，找到要添加的窗体或模块。
注意：添加的窗体名不能与现存的窗体名相同！如果相同，要先改好。
最后，新组合的工程可以另存，也可以直接保存。
建议把这两个工程先拷贝备份。

如果两个原工程都不只一个窗口，他们合并后还能运行吗？原工程内的窗口指向的代码需要人工逐项修改吗？

如果窗体名字改了，有指向窗体的代码肯定也要改。
这些问题你测试下就知道了。