你的循环条件和输入、输出都有问题。红字是修改过的。
#include<stdio.h>  
int main()  
{  
    int k;  
    char ch;
    scanf("%d",&k);
    getchar();
    while(scanf("%c",&ch) && ch!='\n' )  
    {  
        if('a'<=ch&&ch<='z')  
            ch=(ch-'a'+k)%26+'a';  
        if('A'<=ch&&ch<='Z')  
            ch=(ch-'A'+k)%26+'A';
        printf("%c",ch);
    }   
    printf("\n");
    return 0;  
}