这是500多万个碱基长的字符串，当然这只是一个很短的内含子，还有几千万个、甚至几亿个碱基长的，现在要把内含子序列前后翻转过来，即第一个碱基变成最后一个，第二个变成倒数第二个，第三个变成倒数第三个等；实现完这个过程后好要将碱基字符A换成T，T换成A，C换成G，G换成C。     这是我自己编的程序，但运行有问题，请各位大侠帮忙优化或修改一下，谢谢！！！！
#include"stdio.h"
#include"string.h"
#include"stdlib.h"           
FILE *in,*out;
int main()              
{         
 int i;
 int sum;
 static char str[55000000];
 char zifu;
 in=fopen("F:\\寻找内含子序列\\内含子串联负序列.txt","rb");        //第12行
 out=fopen("F:\\寻找内含子序列\\收获1.txt","wb");     
 while(!feof(in))
 {
 fgets(str,sum+1,in);
 sum=strlen(str);
 for(i=0;i<sum/2;i++)
    {
       zifu=str[i];
       str[i]=str[sum-1-i];
       str[sum-1-i]=str[i];     //第一个与最后一个、第二个与倒数第二个等替换   
    }
   for(i=0;i<sum;i++)
   {
      if(str[i]=='A')
      {
       str[i]='T';
       continue;     //加continue表明完成操作后继续循环，不执行下面的；要加{}否则不管第一个if是否成立执行continue继续循环
      }
      if(str[i]=='T')
      {
       str[i]='A';
       continue;
      }
      if(str[i]=='C')
      {
       str[i]='G';
       continue;
      }
      if(str[i]=='G')
      str[i]='C';
   }
 }
  fputs(str,out);
  fclose(in);
  fclose(out);
}

不需要缓存到内存里，倒着读文件即可。

倒着读？用fseek可以吗？
好久没见到您了，最近忙吧！！

各位帮帮忙，这个对我很有用，我是生物物理专业的，谢谢！！！！！！

你上传的文件我下载了三遍都打不开。看了看你的代码，让我觉得有点混乱。

首先你fgets用法不对，第二个参数应该设为str的长度。sum用在这里没有道理。

第二，你的文件里到底包含几个内含子？因为你将fgets放在循环里而fputs却放在循环外，这个逻辑我实在觉得有问题。如果只有一个内含子这个逻辑倒不算错，但while循环是多余的。如果有多个内含子，则只能输出最后一个的操作结果。如果你是考虑str不足以保存一个完整的内含子，那这个逻辑完全不符合你的要求。

我又把文件重新上传了，麻烦您了。
我用sum是用strlen()来统计字符串长度并赋值给sum的。
文件里只有一串内含子，麻烦您了！

这个可以下载！

呵呵，我还是打不开。算了，你试试这段示例代码吧，注意修改文件路径。我没加容错判断，有兴趣请自己补上

#include<stdio.h>

int main()
{
    FILE *fi, *fo;
    char trans[128];
    int i;

    for(i = 0; i < 128; i++) trans[i] = i;
    trans['A'] = 'T';
    trans['T'] = 'A';
    trans['C'] = 'G';
    trans['G'] = 'C';
    
    fi = fopen("内含子串联负序列.txt", "rb");
    fo = fopen("收获.txt", "wb");
    
    for(i = -1; !fseek(fi, i, SEEK_END); i--) putc(trans[getc(fi)], fo);
    
    fclose(fi);
    fclose(fo);
    
    return 0;
}

非常感谢您，您的程序对我帮助很大，解决了一直困扰我的问题，非常感谢您！！！