根据你的程序，是不是就是要一个这样的功能：
> 开头的行略去。
不是的行一肯只含有 agtc 这四个字母，数一数就行了？

这个东西能慢到哪去呀。你上传个数据实例我测测呗。

[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-1 16:40 编辑 ]

你好,版主...
以下是我要读取的输入挡案内容:

[home@cpp]cat input_file.txt
>header_1
ACGTGAGAGATAGAGC
>header_2
AGATGAGATGAGAGATAGA
.
.

写出的c++程序,必须符合一下的条件:
1.若是开头是">",可以直接跳过,无需计算;
2.只计算不是">"的内容.并计算出其总额;
3.将从输入挡案读取及经c++程序处理后的计算结果,存入另一个挡案;
以下是我利用awk语言,所写出的程序内容:

[home@cpp]awk '$0!~">"{total += length($1)}END{print total}' input_file.txt > output_file.txt
[home@cpp]cat output_file.txt
35

以下是我要读取的输入挡案内容(挡案内容,可能会大过1GB):

[home@cpp]cat input_file.txt
>header_1
ACGTGAGAGATAGAGC
>header_2
AGATGAGATGAGAGATAGA
.
.

写出的c++程序,必须符合一下的条件:
1.若是开头是">",可以直接跳过,无需计算;
2.只计算不是">"的内容.并计算出其总额;
3.将从输入挡案读取及经c++程序处理后的计算结果,存入另一个挡案;
以下是我利用awk语言,所写出的程序内容:

[home@cpp]awk '$0!~">"{total += length($1)}END{print total}' input_file.txt > output_file.txt
[home@cpp]cat output_file.txt
35

希望各位c++的高手,可以分享如何利用c++,写出一个类型awk语言的程序...
我利用的awk语言,在读取太大的挡案时,可能会需要很长的时间 :(
因此希望各位高手的c++程序,可以加快挡案的分析速度
谢谢 :)

LZ先说清问题嘛，是不是每行只有agtc这几个字母？
说下你处理的文件大小，耗费的时间。不同的机器上不同的数据也不好说明问题。如果不仅限于C++的特性，对于几G的文件可以试试文件内存映射。

你好，每行多数的可能会是A,C,G,T，N,etc...
我主要的目的，是希望利用c++来计算，除了开头有">"行的内容...
其他行，总共有多少个英文字母的总合...
eg.

>header_1
ACGTGAGAGATAGAGC
>header_2
AGATGAGATGAGAGATAGA

以上的例子，header_1下面的行列，共有16个字母；header_2下面的行列，共有19个字母；
因此，我希望得到的理想结果是16+19= 35...

35

希望我的解释，有让你更了解的 :)
先多谢你的指导噢...

一个多G的文件！那慢点也很正常的，你用 awk 写的要耗多少时间？

我写了一个 sed 的，自己试了试能比 awk 的快3－5倍。
感觉用纯 C 也就最多再快一倍。


[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-1 23:28 编辑 ]

pangding用的多大的文件测试？

31M。不是 ls 了吗～
2880W个字符统计出来花个1秒钟我觉得也正常，这个东西线性的，没什么好算法。1G 的文件我这种老爷机估计都开不开……


[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-2 00:18 编辑 ]

我用 c 语言写了一个，是 0.856s。看来还是比我估计的快了一些

把文件搞大了一倍，再跑就是 1.696s 秒。严格的正比关系～


[ 本帖最后由 pangding 于 2011-7-2 00:26 编辑 ]