printf("\n")；

少了个分号，还有MAIN前面如果不加函数类型有时候也会出错，一定要写
这是个好习惯

粗心是大敌……

LZ啊 LZ啊 可要小心了！这种错误，应该在组建的时候就该发现的！
细节一定要注意！

for(i=0;i<=1;i++)
{
    for(j=0;j<=2;j++)
    {
        printf("%d",a[i][j]);
        b[j][i]=a[i][j];
    }
printf("\n");
}
printf("新数组为:\n");
for(j=0;j<=2;j++)
{
    for(i=0;i<=1;i++)
    {
        printf("%d",b[j][i]);
    }
printf("\n")
}
好像应该为
for(j=0;j<=1;j++)
{
    for(i=0;i<=2;i++)
    {
        printf("%d",a[i][j]);
        b[j][i]=a[i][j];
    }
printf("\n");
}
printf("新数组为:\n");
for(j=0;j<=2;j++)
{
    for(i=0;i<=1;i++)
    {
        printf("%d",b[j][i]);
    }
printf("\n")
}

这种小错误一定要自己找出来，，，通过编译器一眼就看出来了，，服了。