int FLAGTEST;
.
.
void CAt45041::OnBtnAt45041AutoTest()
{
    while(FLAGTEST==1)

    {
        ............
        {
            ..........   
        }
        Sleep(1000);
    //    SuspendThread(GetCurrentThread());
    //    ResumeThread(GetCurrentThread());
        
    }

}
void CAt45041::OnBtnAt45041AutoStop()
{
    FLAGTEST=0;//改变全局变量，停止循环；
}
            我想通过点击按钮OnBtnAt45041AutoStop来改变全局变量FLAGTEST 来停止循环，但是循环在继续，sleep（）也无济于事，cpu占100%。    怎么办呢？   请高手指点！！！。。

不懂.

信息不够，无法分析原因。
从给出的代码部分来看，全局变量赋值为0是可以退出循环的。
你需要确定一些事情：
1、两处的FLAGTEST变量是否是同一个，加断点取内存地址就知道了；
2、赋值后，是否真的没有退出循环，在循环中加断点；
3、如果没有退出，FLAGTEST变量值是否是在什么地方又被赋值为1了；