public class UserDAO extends DBConnection {
    public int flag;
    public PreparedStatement ps;
    public Connection conn;
    public ResultSet rs;
public boolean refer(UserDTO dto) {
        conn = getConnection();
        String sql = "select * from tb_user where user_id=?";
        try {
            ps = conn.prepareStatement(sql);
            ps.setInt(1, dto.getUser_id());
            rs = ps.executeQuery();
            if (rs.next()) {
                int id = rs.getInt("user_id");
                 String name = rs.getString("user_name");
                String pass = rs.getString("user_pass");
                return true;
            }
        } catch (SQLException e) {

            e.printStackTrace();
        } finally {
            close(conn, ps, rs);
        }
        return false;
    }

}

问题:怎么样在main函数中输出id,name,pass?

在main函数中输出？
你的id、name、pass都是局部变量，main函数中拿不到。
如果只是想在控制台打印出来，可以在
if (rs.next()) {
                int id = rs.getInt("user_id");
                 String name = rs.getString("user_name");
                String pass = rs.getString("user_pass");
                return true;
            }
中间插入
System.out.println(id);
System.out.println(name);
System.out.println(pass);
来输出。

如果非要在main函数中拿到，那么就需要把这3个变量设为UserDAO的属性，并且写上set和get方法。

在类里写一个方法用来查询数据， 再到main函数中创建对象调用这个方法

你这里用的貌似是DAO模式，传进去的是一个 UserDTO dto的对象，那就应该把查询到的值放到UserDTO dto这个对象里边，要调用只要在外边创建者个类的对象直接就可以通过访问器调用其值了,如果不需要这样，就像上边说的那样将id，name设置为全局变量
   

朋友，你比我天真，路过，飘一下