#include <stdio.h>
void main()
{
    int a;
    printf("请输入一个数字:");
    scanf("%d",&a);
    if(1>=a>=5)
        printf("你输入的数比6小!");
    else 
        if (6>=a>=9)
        printf("你输入的数字比5大");
    else
        printf("请输入1~9之间的整数");
}

你的两个if的判断条件有问题

简单说说：
楼上正解
看起来C语言的语法规则 虽然是自洽的一套完善体系 可是和数学性相比 还有不少常用的公式套路没有添加进去
这是C语言尚不完全合理化完备的
只要用习惯了 服从C规则 将来也就不会出这种问题了  
哎 想起来日本的 世界奇妙物语 系列里面的那篇短片  初次公园  来了