呵呵，我以前也有过类似的问题，我装的是xp和win2003，xp在主分区，重装xp之后就不能进2003了，最后发现是2003的启动给丢掉了，然后我自己找了一张盘进2003修复，使用命令行bootcfg /list显示了我有的系统启动，当然只有xp了啊,无奈之下我又用bootcfg/add，自己照着xp的启动项，自己写了一个03的启动项，呵呵，重启之后就ok了啊。

其实现在我知道了
就像和装系统一样
因为微软在做系统的时候没有考虑到双系统
你重装系统时就把前一次的休息全格了，所以
就数据丢失他只认后面装的不认以前的系统
因为他没有在BOOT文件里注册
我当初装WINDOS与LINUX以是一样
我先装linux在装windos就可以正长选择
反之就没有linux的选项就只有在boot文件下添家
在连接很麻烦的所以你装好了双系统就不要把以前
第一次装的哪个系统格了不然又要出现类事的问题了
呵呵

以前在一块硬盘上装过三个系统，先在C盘装98，D盘装XP，E盘装2003，装上都没什么问题，
就先前在试装双系统的时候出现过你说的问题，不过那是我自己找到问题出在哪了

话不能说得太绝对哦！我就常常先装XP，后装2000 （当然最好还是推荐像楼上的那个顺序装就是了）
关键在于装完后的文件配置和替换。
如果先装XP，后装2000，可如下操作：
1、boot.ini 里如果少了某个系统的启动项，自己添加；
2、NTDETECT.COM 和ntldr 要使用版本较高的那个系统对应的（当然，用win 2003自带的也可以）；

先把主分区全部格式化后,先装win2000,再装xp!(同放在C盘都不会有问题!)